Доброго времени суток.
Для начала следует установить причину, по которой появилось столько много воды в пространстве между стяжкой и покрытием пола, так как именно ее нам предстоит устранить
Если дело заключается в том, что грунтовые воды залегают близко к поверхности или значительно поднимаются во время таяния снега, то необходимо будет организовать дренажную систему, которая снизит уровень грунтовых вод не позволяя ему подбираться к полу. Вариант не очень «веселый», однако необходимый, иначе полы всегда будет заливать водой. Чтобы проверить уровень грунтовых вод придется провести геолого-разведку, на крайний случай можете обратиться к соседям, которые находятся в непосредственной близости около Вашего дома, чтобы узнать случается ли них такое.
Второй вариант более простой. Я вижу, что у Вас не организована гидроизоляция горизонтальной поверхности пола. В результате влага из грунта «вытягивается» бетоном, после этого и получается наличие воды под покрытием пола, отсюда сырость, повышенная влажность и в результате развитие плесени и грибков. Нас такой вариант не устраивает. Сейчас существует очень большой выбор гидроизоляционных материалов, так что Вам предстоит выбрать один из них — тщательно ознакомьтесь с гарантиями производителя, поговорите с торговыми представителями и сделайте выбор в пользу наилучшего материала по показателям при доступности его цены для Вас. Клеенка как гидроизоляция не достаточна, она способна работать скорее как пароизоляция и находиться не совсем там, пароизоляция устраивается после теплоизоляции, чтобы воспрепятствовать доступу влаги из помещения в слой теплоизоляции.