Доброго времени суток.
Должен признаться, что довольно интересный способ осуществления вывод вентлияционных выводов из шахт после того, как будет собрана крыша, т.е. ее придется частично демонтировать — быть может по этому поводу у них были соображения — об этом судить сложно. Судить правильно ли это — также невозможно, так как каждый строитель делает не всегда, основываясь на «классические» монтажные способы.
Вывод вент. шахт на крышу делать нужно, так что в этом плане у Вас особо выбора нет, а вот на счет протечки и мостика холода — вариант их появления есть, так как вообще места стыковки с такими элементами в крыше всегда являются «слабыми» местами, так что все будет зависеть от того, как качественно будут сделаны данные места сопряжения. Если работа будет выполнена качественно, то проблем особых возникнуть не должно.